Los objetivos de Departamento de Secretaría son:

• Apoyo al funcionamiento de los órganos y comisiones de Cogobierno del CENUR (Consejo, Asamblea del Claustro, Comisiones Directivas y Comisiones Asesoras).
• Tramitación y archivo de expedientes y otros documentos.
• Control de cumplimiento de la normativa vigente y disposiciones adoptadas por las autoridades, que refieren a las funciones universitarias y su gestión.
• Asesoramiento en materia de resoluciones y normativa a los integrantes de los órganos de Cogobierno y usuarios del servicio.
• Asistencia administrativa y asesoramiento en la elaboración, seguimiento y gestión, de convenios de Cooperación académica, nacionales e internacionales.
• Enlace con la Dirección General de Relaciones y Cooperación de Udelar, asesorando sobre procedimientos administrativos y reglamentarios para la presentación de convenios
  
• Apoyo administrativo a la Unidad de Educación permanente.
  
• Promoción de la capacitación del personal en el manejo de los sistemas y procedimientos del área.
• Brinda atención diaria de solicitudes de información, resoluciones, materiales anteriores o actuales, consultas respecto a la aplicación de normativa, tramitación de expedientes, gestión de asuntos radicados en la Secretaría, relevamiento de datos y antecedentes.
  
• Busca solucionar problemas e inquietudes que se presenten intentando corregir procedimientos que pudieran estar perjudicando el logro del producto buscado.